# 用語集

本マニュアルで使う量子化学・HPC 用語のクイックリファレンス。各項目は、詳しく説明した章へリンクします。

## 量子化学

**AO（原子軌道）**
: 原子中心の基底関数。[基底関数系](../20-guide/basis-and-ao.md)は AO の集合です。

**基底関数系（basis set）**
: 分子軌道を展開する有限の関数集合（[基底の章](../20-guide/basis-and-ao.md)）。

**BSSE（基底関数重ね合わせ誤差）**
: フラグメントが互いの基底関数を借りて起こる人工的な安定化;[ゴースト原子](../40-reference/mol-spec.md)で補正。

**Born–Oppenheimer 近似**
: 核が電子よりはるかに重いので、核を固定して電子問題を解くこと（[基礎](../10-foundations/many-electron-and-bo.md)）。

**相関エネルギー**
: $E_{\text{corr}} = E_{\text{exact}} - E_{\text{HF}}$ — Hartree–Fock が外す電子回避のエネルギー
  （[ポスト SCF](../20-guide/post-scf.md)）。

**CGTO（縮約ガウス型軌道）**
: 基底関数として使う、プリミティブガウス関数の固定線形結合（[基底の章](../20-guide/basis-and-ao.md)）。

**DFT（密度汎関数理論）**
: 電子密度に基づく電子構造法;実際には Kohn–Sham DFT（[基礎](../10-foundations/dft-kohn-sham.md)）。

**DIIS**
: 反復部分空間の直接反転 — 既定の SCF 収束加速（[SCF](../20-guide/scf.md)）。

**ECP（有効内殻ポテンシャル）**
: 重原子の内殻電子を置き換えるポテンシャル（コスト削減・スカラー相対論;[基底の章](../20-guide/basis-and-ao.md)）。

**ELF（電子局在化関数）**
: 電子対 — 内殻・結合・孤立電子対 — を明かす実空間場（[QTAIM と ELF](../20-guide/properties/qtaim-elf.md)）。

**ERI（電子反発積分）**
: 二電子積分 $(\mu\nu|\lambda\sigma)$;その扱い方が `eri=` 戦略（[ERI 戦略](../30-hpc/eri-jk-strategies.md)）。

**Fock / Kohn–Sham 行列**
: その固有ベクトルが分子軌道である実効一電子演算子（[SCF](../20-guide/scf.md)）。

**汎関数（`xc`）**
: DFT の交換相関近似（LDA/GGA/meta-GGA/ハイブリッド;[基礎](../10-foundations/dft-kohn-sham.md)）。

**HOMO / LUMO**
: 最高被占 / 最低空 分子軌道;そのギャップが反応性を測る
  （[スペクトルと DOS](../20-guide/properties/spectra-dos.md)）。

**J / K（クーロン / 交換）**
: Fock 行列の二電子部分 — 古典反発（J）と交換項（K）。

**LCAO**
: 原子軌道の線形結合 — 分子軌道の作り方（[基礎](../10-foundations/variational-lcao-basis.md)）。

**MP2（2 次 Møller–Plesset）**
: 相関エネルギーの最も安価なポスト HF 推定（[ポスト SCF](../20-guide/post-scf.md)）。

**多重度（2S+1）**
: スピン状態 — 1 = 一重項、2 = 二重項、3 = 三重項（[分子の入力](../20-guide/molecular-input.md)）。

**QTAIM（分子中の原子の量子論）**
: 密度トポロジーの Bader 解析 — 原子・結合・ベイスン（[QTAIM と ELF](../20-guide/properties/qtaim-elf.md)）。

**RHF / UHF / ROHF**
: 制限 / 非制限 / 制限開殻 Hartree–Fock — 3 つの参照（[SCF](../20-guide/scf.md)）。

**RI（恒等分解 / 密度フィッティング）**
: 4 指標積分を補助基底で近似（[ポスト SCF](../20-guide/post-scf.md)、[ERI 戦略](../30-hpc/eri-jk-strategies.md)）。

**SCF（自己無撞着場）**
: Fock/Kohn–Sham 方程式の反復解法（[SCF](../20-guide/scf.md)）。

**スピン汚染**
: UHF 波動関数への高スピン状態の混入;⟨S²⟩ で測る（[SCF](../20-guide/scf.md)）。

## 高性能計算

**Amdahl の法則**
: プログラムの逐次割合が最大並列高速化を制限する（[入門](../30-hpc/parallel-computing-primer.md)）。

**BLAS / LAPACK**
: 密な線形代数のチューニング済みライブラリ（MKL または OpenBLAS;[スレッドの章](../30-hpc/threads-and-blas.md)）。

**GPU / CUDA**
: 超並列アクセラレータと、その NVIDIA の基盤（[GPU の章](../30-hpc/gpu-cuda.md)）。

**InfiniBand**
: 高性能クラスタ相互接続（Ethernet の ~35 倍;[MPI の章](../30-hpc/mpi-and-interconnects.md)）。

**MPI（メッセージパッシングインターフェース）**
: 多数マシンの分散メモリモデル（[MPI の章](../30-hpc/mpi-and-interconnects.md)）。

**オーバーサブスクリプション**
: コア数より多くのスレッドを要求し、実行が遅くなること（[スレッドの章](../30-hpc/threads-and-blas.md)）。

**プロセス / スレッド**
: 専用メモリを持つプログラム / プロセスのメモリを共有する実行の流れ
  （[入門](../30-hpc/parallel-computing-primer.md)）。

**ランク**
: 1 つの MPI プロセス（[MPI の章](../30-hpc/mpi-and-interconnects.md)）。

## qc-rs の概念

**チェックポイント**
: qc-rs の中心オブジェクト — 構築・拡張・実行・問い合わせする分子（[チェックポイント](../40-reference/checkpoints.md)）。

**IOP**
: 詳細な数値ノブのための `iop={...}` チャネル（[IOP リファレンス](../40-reference/iop.md)）。

**センチネル**
: コンパイル済み機能を報告する `qc.*_ENABLED` の真偽値（[API リファレンス](../90-api/qc.md)）。