qc パッケージ#

公開 qc サーフェスの厳選リファレンス。シグネチャは一般的なキーワード引数を示します;まれな数値ノブは IOP キー です。

チェックポイントの構築#

qc.chk.new(atom, ao, *, ao_rep="spherical", charge=0, spin=1, unit="angstrom", ric=None, rijk=None, iop=None, backend=...)

分子入力からチェックポイントを作成。atommol-spec 文字列;ao は基底名 または原子ごとの辞書;spin は Gaussian 多重度 2S+1;unit"angstrom"(既定)または "bohr"; ric/rijk は RI 補助基底;iop は詳細オプション辞書。チェックポイントを返します。

qc.chk.load(path) / mychk.save(path)

チェックポイントを復元 / 永続化(HDF5 .qch5)。

mychk.with_iop({...})

IOP キーを重ねた新しいチェックポイントを返す。

ワークフロー動詞#

各動詞は保留ステップを追加し新しいチェックポイントを返します;.run() が結果を材料化します。各動詞は関数 形式 qc.verb(mychk, ...) とメソッド形式 mychk.verb(...) を持ち — 同一です。

動詞

主な引数

追加するもの

guess(mychk, kind="sad", *, source=, occupation=, spin_break=)

sad/minao/harris/sap/gwh/core/read

初期推定ステップ

ints(mychk, *, eri="4c-auto", dipole=False)

ERI 戦略

積分材料化ステップ

scf(mychk, *, ref="auto", xc=None, grid="medium", algorithm="auto", conv_tol=, conv_preset=, max_cycle=, pcm=, dispersion=, stability=, smearing=, level_shift=, damping=, mom=, symmetry=, prop=)

SCF 制御

SCF ステップ

lct(mychk, *, method="mp2")

mp2/scs-mp2/sos-mp2(実);cc2/CASPT2/NEVPT2(モック)

相関ステップ

casscf / fci / dmrg / td

モック手法ステップ

grad(mychk) / mychk.scf.gradient

解析的核勾配

mychk.scf(...).opt(*, coordsys="tric", maxiter=100)

geomeTRIC 制御

構造最適化ステップ

.run(*, log=None, log_style="modern", plot=False, nthread=None, nmpi=1, hosts=None, comm=None, log_rank="root")

保留ステップを実行。log はトランスクリプトを流す("stdout"/パス/オブジェクト);nthread/nmpi/hosts/comm が並列性を設定(Part IV)。

結果アクセサ#

.run() の後(詳細は チェックポイント):

mychk.scf.energy / .converged / .ncycle / .energy_elec / .energy_components / .gradient / .stability
mychk.lct.energy / .e_corr / .e_os / .e_ss
mychk.opt.converged / .energy / .e_traj / .gmax_traj / .grms_traj
mychk.natom / .symbols / .charge / .spin / .nelectron() / .coordinates() / .nuclear_energy()
mychk.log(format=) / .show() / .run_events()

qc.prop — 分子物性#

qc.prop.<group>.<leaf>(mychk)(≡ mychk.prop.<group>.<leaf>())、遅延評価・キャッシュ。14 群:

chrg

原子電荷

qtaim

QTAIM トポロジー / ベイスン

bond

結合次数

elf

ELF/LOL ベイスン

mpol

電気モーメント、分極率

arom

芳香族性指標

cdft

反応性、Fukui

orb

軌道解析

nbo

NBO / IAO / IBO

spin

スピン密度、⟨S²⟩

esp

静電ポテンシャル

spec

DOS、ギャップ、バンド中心

mesh

実空間グリッド場(NCI/IGM)

geom

幾何解析

scf(..., prop=True|preset|[refs]) はバンドルを一括計算します。物性スイート 参照。

その他の名前空間#

qc.iop — オプションレジストリ:qc.iop.list(), qc.iop.describe(key), qc.iop.defaults()リファレンス)。

qc.basis — 基底データ:qc.basis.baslib_filename(229 名)、qc.basis.nwchem_format(inpdata, description=, ecp=)リファレンス)。

qc.view — 可視化:mychk.view3d(field|orbital|orbitals, ...), mychk.mo_cube(...), mychk.orbitals, mychk.plot_nci(), mychk.plot_convergence(), mychk.plot_field_plane(...), .to_html()可視化)。

低レベル(直接使うことはまれ): qc.array(N 次元配列、eigh、要素ごと/簡約演算)、qc.mol(分子データ モデル)、qc.utils(例 qc.utils.quatdiag)、qc.integrals(実験的な libcint ベースの殻/テンソルヘルパ)。

任意モジュール(機能ゲート、センチネルで保護): qc.xc(libxc 汎関数;qc.XC_ENABLED)、qc.pcm(PCM 溶媒和コンテキスト;qc.PCM_ENABLED)、Rust MPI-direct 関数(qc.MPI_DIRECT_ENABLED)、GPU 経路 (qc.GPU_ENABLED)。

センチネル#

import qc
qc.XC_ENABLED, qc.PCM_ENABLED, qc.MPI_DIRECT_ENABLED, qc.GPU_ENABLED

各々、対応する機能がビルドに組み込まれた場合のみ True です。既定ビルドは XC_ENABLED == PCM_ENABLED == MPI_DIRECT_ENABLED == TrueGPU_ENABLED == False(GPU 経路はオプトイン; GPU の章)です。


これが公開サーフェスです。ここから、ガイドの章 が各要素を文脈の中で示し、 リファレンス の各節が網羅的な詳細を与えます。